哈佛大学开发出FISH分析交换反应信号放大技术让DNA和RNA更明亮皮革机械
时间：2022/07/14 15:44:10 编辑：
05-22
来自哈佛大学威斯生物工程学院和哈佛医学院的一个合作研究团队近日开发出了一种“交换反应信号放大”技术（Signal Amplification by Exchange Reaction，SABER），显著提高了FISH分析的灵敏度、定制和多路复用能力。经检测，SABER-FISH技术可以使视网膜组织清晰地呈现不同的层，感光层定位在顶部。每一层都含有多种特殊的神经元细胞，可以通过该方法检测到的独特RNA分子来识别。
几十年来，研究人员一直在使用“荧光原位杂交”（Fluorescence in situ hybridization，FISH）分析技术，从完整的细胞和组织中寻找特定的DNA和RNA序列。但利用FISH从组织中、特别是在发出非特异性背景荧光的厚组织中寻找稀少的序列，以及在多路复用分析中同时检测多个目标，仍然是一个挑战。虽然科研人员已经开发出几种方法用以放大较弱的FISH信号，但这些方法不容易定制，无法同时显示大量的DNA或RNA目标分子，而且成本昂贵，难以使用。
为解决以上问题，来自哈佛大学威斯生物工程学院和哈佛医学院的一个合作研究团队近日开发出了一种“交换反应信号放大”技术（Signal Amplification by Exchange Reaction，SABER）。经检测，该技术高度可编程且非常实用，显著提高了FISH分析的灵敏度、定制和多路复用能力。他们的研究结果发表在《自然·方法》杂志上。研究显示，SABER能够在小鼠视网膜不同层的不同RNA和DNA靶点上放大FISH信号，并同时在人类X染色体上显示多达17个不同的目标区域。此外，研究人员还利用SABER识别了一种控制特定基因转录的基因元件。
“我们将重组DNA结构引入视网膜细胞中，这些元件分别耦合了一个报告系统，通过进行SABER-FISH分析来量化单个细胞中DNA结构的拷贝数以及报告系统的表达情况，我们能够将特定增强子的活性与细胞类型特异性表达关联在一起“研究人员说，“SABER-FISH的敏感性和更简单、更廉价的工作流程使我们能够从视网膜的实验中收集更多的信息，从而了解控制其发育的调控网络、。重要的是，这种方法有潜力同样加强对许多其他类型组织和器官的研究。”